舟山方舟会计师事务所于1999年10月按照财政部、审计署关于会计师、审计师事务所有关改制文件精神，经浙江省财政厅批准改制设立，在舟山市工商行政管理局注册登记，独立从事法定审计会计业务的社会中介组织。
主要从事国内企业事业单位、外商投资企业、三资企业的财务收支审计，年度会计报表审计，验证企业注册资本，高新技术企业审计,科技项目审计,经济责任审计，基本建设全过程跟踪审计,代理记账，司法鉴证，担任常年审计会计顾问，提供会计管理咨询，培训审计会计人员、政府采购代理、项目代建等业务。每年承担审计项目达千余项，在审计质量和社会效益上均得到社会各界的信任和赞赏，有力地支持了舟山市的经济建设。
事务所是本市享有盛誉的社会审计机构。目前规模、效益、执业水平又上了一个新的台阶。在年报审计、财务收支审计、各类司法鉴证等方面，积累了丰富的经验，从中培养出一大批资深的注册会计师等优秀人才，为今后事务所的壮大和发展奠定了良好的基础。
目前事务所共有从业人员30余名，其中注册会计师10名，拥有高级职称3名，90%以上为中级职称；注册会计师学历均在大专以上。从业人员均能恪守“独立、客观、公正”的执业原则，严格遵守职业道德规范，通过平时自觉学习业务知识，以及每年既定的继续教育培训，不断更新和提升业务技能，至今未发生过过失或过错等审计失败案例。注册会计师中的绝大部分人员已经成为审计、财政、科技等有关部门的专家或专家库成员。目前事务所已具备规模大、力量强、素质好、业务广的审计综合实力。
事务所自成立以来建立了一套完整的内部制度和纪律，如人事、财务、质量、档案、培训等制度，每个审计人员工作中受到严格的审计纪律约束，并规定承接项目必须做到“质量、时效、信誉”三保证。在业务质量控制上，更是制订了严格的质量控制体系，实行三级复核制度。舟山方舟会计师事务所奉行“质量为本、服务第一、信誉至上”的服务宗旨，竭诚为社会各界提供优质、高效、快捷的会计审计服务。